Els nostres biòlegs fan servir un microscopi aproximadament cinc vegades més potent que els microscopis habituals d’un laboratori de fecundació in vitro (aconsegueix més de 6.000 augments), cosa que els permet examinar els espermatozoides minuciosament; fins i tot poden observar amb detall orgànuls intracel·lulars com ara els vacúols, que provoquen desestabilització en la cromatina.
D’aquesta manera s’aconsegueix estudiar de prop la morfologia de l’espermatozoide i descartar aquells que són deformes o no aptes per a la fecundació, ja que, normalment, un òvul fecundat per un espermatozoide defectuós acaba en avortament. En canvi, amb la IMSI, en poder seleccionar espermatozoides sense alteracions morfològiques, s’incrementen les taxes de fecundació i d’implantació, millora la qualitat embrionària i disminueixen les taxes d’avortament.